Apa itu Genomik?

Pada tahun 1920, H. Winkler menciptakan istilah genom untuk menggambarkan ‘set lengkap gen kromosom dan ekstra-kromosom dari suatu organisme atau virus’. Pada eukariota, DNA juga terdapat di dalam mitokondria dan kloroplas (hanya pada tumbuhan).

Setelah jeda 66 tahun, Thomas Roderick pada tahun 1986 pertama kali menggunakan istilah genomik dan menggambarkannya sebagai disiplin ilmu pemetaan, pengurutan, dan analisis genom. Definisi ini tidak jelas tetapi menekankan eksploitasi sistematis informasi genom untuk menjawab beberapa pertanyaan yang muncul dari biologi atau bidang terkaitnya.

Sekarang jumlah, lokasi, ukuran dan organisasi dari semua gen yang diperlukan untuk membentuk suatu organisme dapat diketahui. Signifikansi genomik secara substansial meningkat ketika Proyek Genom Manusia disusun pada tahun 1987. Secara resmi, Proyek Genom Manusia dimulai pada Oktober 1990 di AS

Proyek Pengurutan Genom :

Di seluruh dunia, para ilmuwan mencoba mengurutkan genom secara lengkap dari beberapa organisme dari kelompok penting. Alasan pengurutan genom diberikan di bawah ini:

  1. Memberikan pengetahuan tentang jumlah semua gen
  2. Menunjukkan hubungan antar gen
  3. Ini memberikan peluang untuk mengeksploitasi urutan untuk eksperimen yang diinginkan
  4. Ini memberikan semua informasi genetik tentang organisme
  5. Urutan genom bertindak sebagai arsip dari semua informasi genetik

Pekerjaan penelitian Proyek Genom Manusia berhasil diselesaikan hanya karena kolaborasi internasional yang melibatkan 60 negara, 20 pusat penelitian genom, dan lebih dari 1.000 ilmuwan. Hingga tahun 1990, beberapa laboratorium mengurutkan 100.000 nukleotida.

Proyek Genom Manusia mendapat bantuan internasional dan informasi penting dihasilkan. Pada tanggal 26 Juni 2000 ‘draft kerja’ genom manusia telah selesai. Pengumuman penyelesaian draf ini menangkap imajinasi orang-orang di seluruh dunia saat manusia berjalan di bulan. Genom manusia besar terdiri dari pasangan basa -3 x 10′ dan banyak urutan berulang. Memindai mikrograf elektron dari kromosom manusia.

3 miliar karakter dalam urutan DNA yang menyusun genom manusia diterjemahkan menjadi informasi yang bermakna secara biologis dengan menggunakan komputer. Tindakan ini melahirkan bidang baru yang disebut ‘Bioinformatika’. Bidang genomik bergantung pada bioinformatika. Ini memegang kunci untuk membuka data ini untuk inovasi generasi berikutnya.

Selain itu, lengkapi seluruh urutan genom lebih dari 1.000 virus, lebih dari 100 mikroba dan 9 eukariota diketahui. Ratusan proyek pengurutan genom sedang berlangsung di berbagai belahan dunia dan banyak yang sedang dimulai.

Beberapa genom yang diurutkan secara lengkap termasuk fag X, HIV, E. coli (4.639xl0 6 bp), Helicobacter pylori menyebabkan kanker perut (1.67xl0 6 bp), ragi Saccharomyces cerevisiae (12.1xl0 6 bp), cacing nematoda Caenorhabditis elegans (100 x l0 6 bp) dan Drosophila melanogaster yang subur (160 x10 6 bp).

Banyak proyek pengurutan genom lainnya sedang berlangsung termasuk tumbuhan, ikan, dll. Pada akhir 1999, 97% kromosom 22 (34,5 x 10 6 bp) telah diurutkan.

Pada tahun 1995, genom yang diurutkan lengkap dari dua bakteri smaWest pertama, Haemophilus influenza Rd dan Mycoplasma genitalicum, dilaporkan. Pada tahun 1996, sekuensing genom Saccharomyces cerevisiae ragi pertama selesai. Pada tahun 1997, pengurutan genom dari dua bakteri yang paling banyak dipelajari, subjudul Escherichia coli dan Bacillus selesai.

Beberapa program komputer diadopsi untuk analisis data. Untuk melakukan perakitan urutan, beberapa program komputer baru juga dapat ditulis.

Pengurutan genom dari banyak bakteri termasuk yang penting bagi medis dan industri, dan dari lingkungan ekstrem {misalnya gunung berapi dan ventilasi laut dalam) ditentukan di ‘The Institute of Genomics Research (TIGR), Maryland (AS). Lembaga ini didirikan oleh Craig Venter.

Genomik mengurutkan genom manusia dan tikus. Genom manusia yang memiliki lebih dari 3 x 10 9 bp juga memiliki urutan yang berulang. Adanya sequence yang berulang menimbulkan kesulitan dalam perakitan sequence. Tapi mungkin akan sedikit lebih mudah untuk dirakit jika bagian-bagiannya mengandung gen.

Pada awal tahun 2000, genom dari 23 organisme uniseluler yang berbeda (5 archaeal, 17 bakteri, dan 1 organisme eukariotik telah diurutkan secara lengkap.

Related Posts