Jai Singh digantikan oleh Pangeran Muazzam sebagai Raja Muda Deccan dan dia dibantu oleh Jaswant Singh. Saat ini terjadi pemberontakan Yusufazai pada Maret 1667. Hal itu memaksa Aurangzeb untuk tidak mengambil tindakan terhadap Shivaji. Shivaji juga menyadari bahwa dia tidak mampu untuk bertengkar dengan Mughal sampai dia mengatur sumber dayanya. Shivaji memenangkan Jaswant Singh untuk menengahi demi kebaikannya dengan Aurangzeb untuk perdamaian. Aurangzeb juga mendambakan perdamaian. Hasilnya selama 3 tahun dari 1667 hingga 1669 Shivaji hidup damai dengan Mughal.
Pada bulan Januari 1670 Shivaji memulai serangan yang kuat terhadap Mughal. Karena para Jenderal Mughal bertengkar di antara mereka sendiri, mereka tidak dapat melanjutkan perang dengan semangat. Hasilnya Shivaji mendapat kesempatan untuk menyerang Wilayah Mughal dan mampu memperluas aktivitasnya bahkan hingga ke Berar. Terjadi pertempuran yang tidak menentu dan setengah hati di pihak Mughal selama beberapa waktu, tetapi setelah pemindahan Diler Khan untuk menghadapi situasi di Celah Khyber pada tahun 1674 di mana orang Afghanistan memberontak, terjadi jeda dalam perang Deccan.
Karena masalah perbatasan berlanjut untuk waktu yang lama, tekanan Mughal pada Shivaji dilonggarkan. Penjarahan Shivaji pada Juli 1674 di kamp Jenderal Mughal Bahadur Khan. Pada bulan Agustus, September dan Oktober 1674, band Maratha menyebar ke negara Koli. Pada akhir Januari 1675, kelompok lain dari 3.000 Kavaleri Maratha menutupi Distrik Kolhapur dan memungut Chauth dari kota.
Shivaji membuka negosiasi perdamaian yang menyesatkan dengan Bahadur Khan dan dengan demikian berhasil membuatnya diam. Setelah itu, dia bersekutu dengan Bijapur dan merencanakan penyerangan ke Karnataka. Bahadur Khan juga lelah dengan perang dan setuju untuk berdamai dengan Shivaji setelah menerima suap. Shivaji dan Golcunda.
Setelah berdamai dengan Mughal, Shivaji menjalin persahabatan dan kerja sama yang erat dengan Golcunda sehingga Kampanye Karnataka-nya bisa sukses. Golcunda membuat aliansi anak perusahaan dengan Shivaji dan menjanjikannya penghargaan tahunan sebesar satu lac Hun untuk mempertahankan Golcunda. Shivaji ingin agar Penguasa Golcunda menanggung biaya kampanye dan meminjamkannya pasukan tambahan sebagai imbalan atas bagian dari penaklukan dan untuk tujuan itu dia melakukan wawancara.
Disepakati bahwa Sultan akan membayar 4,5 lac rupee sebulan dan mengirim 5.000 tentara untuk bekerja sama dengan Shivaji. Hal ini mengakibatkan penaklukan wilayah yang menghasilkan 20 lac Hun setahun, selain jarahan yang sangat berharga yang mengisi kembali perbendaharaan Shivaji yang kosong.
Pada pertengahan Januari 1678, Shivaji kembali ke rumah dan berencana untuk merebut Bijapur, tetapi gagal. Sekembalinya, Shivaji menaklukkan Sudut Selatan Kerajaan Bijapur, yang terdiri dari Distrik Kopal, Dharwar dan Belgaum dan dengan demikian menggabungkan harta lamanya di Maharashtra dengan yang baru di Karnataka. Perpecahan terjadi antara Shivaji dan Penguasa Golcunda karena Shivaji tidak memberinya bagian apa pun dari jarahan dan penaklukan Karnataka dan berencana untuk merebut Bijapur.
Sebuah perang akan terjadi jika bukan karena tindakan permusuhan dari Jenderal Mughal Diler Khan melawan Bupati Bijapur Sidi Masaud yang merupakan sekutu Penguasa Golcunda melawan Shivaji. Jika perang dengan Golcunda dan Bijapur dapat dihindari, perang lain pecah dengan Mughal di mana Shivaji dan Bupati Bijapur bersekutu. Pada April 1680, Shivaji meninggal.
Shivaji digantikan oleh putranya Sambhaji. Pada tahun 1681, Pangeran Akbar, buronan putra Aurangzeb, datang ke istana Sambhaji. Sambhaji memberinya perlindungan. Hampir delapan bulan berlalu ketika Aurangzeb dengan pasukan besar datang dan “mengambil pos di pusat strategis Aurangabad” pada Maret 1682. Aurangzeb bertekad untuk menghancurkan Sambhaji yang telah memberikan perlindungan kepada putranya yang memberontak, Pangeran Akbar. Aurangzeb meminta Bijapur dan Golcunda untuk membantunya menaklukkan Marathas.
Mereka menolak karena mereka tahu bahwa setelah menaklukkan Marathas, Aurangzeb juga akan menghancurkan mereka. Aurangzeb sangat kesal sehingga dia memutuskan untuk menghancurkan Bijapur dan Golcunda sebelum menghancurkan Marathas. Pada saat ini, Sambhaji seharusnya membuat alasan yang sama dengan Bijapur dan Golcunda dan menyerang Mughal, tetapi dia tidak melakukannya. Dia mungkin tidak menyadari bahwa penghancuran Bijapur dan Golcunda akan memudahkan tugas Aurangzeb untuk menghancurkannya juga.
Setelah itu, dia mengirim pasukan ke Konkan Selatan di bawah Pangeran Muazzam tetapi ekspedisi itu gagal. Ada kerugian besar bagi Mughal (September 1683-Mei 1684).
Penaklukan Bijapur (1686)
Aurangzeb meminta Penguasa Bijapur sebagai pengikut untuk memasok perbekalan kepada Tentara Mughal, untuk mengizinkan Tentara Mughal melewati wilayahnya dengan bebas dan juga memasok kontingen yang terdiri dari 5.000 hingga 6.000 kavaleri untuk perang melawan Marathas. Dia juga menuntut agar Sharza Khan yang merupakan pemimpin Bangsawan Bijapuri yang menentang Mughal, diusir dari Bijapur. Penguasa Bijapur memohon bantuan kepada Golcunda dan Sambhaji.
Pada bulan April 1685, pengepungan Bijapur dimulai oleh Pangeran Azam dan Kahn-i-Jahan Bahadur. Pada tanggal 24 Mei 1685, Aurangzeb maju ke Sholapur untuk berada di dekat lokasi operasi. Tak puas dengan itu, Aurangzeb tiba di Bijapur pada 3 Juli 1686. Pada 12 September 1686 Raja Bijapur Sikandar Adil Shah menyerah. Aurangzeb memerintahkan aneksasi Bijapur dan pindah ke Golcunda.
Aneksasi Golcunda
Aurangzeb memiliki banyak keluhan terhadap Golcunda yang penguasanya telah memberikan kekuasaan tertinggi kepada dua orang kafir, Madanna dan Akhanna yang sangat tidak menyenangkan di mata Aurangzeb. Penguasa Golcunda juga telah membantu Shivaji dalam berbagai kesempatan. “Pengkhianatan” terbarunya adalah dia mengirim 40.000 orang untuk membantu Bijapur melawan Aurangzeb meskipun ada peringatan.
Terlepas dari perlawanan keras, Mughal menduduki Golcudna pada tahun 1685; Aurangzeb menawarkan untuk mengampuni Penguasa Golcunda dengan imbalan subsidi besar, penyerahan beberapa daerah dan penggulingan Madanna dan Akhanna. Penguasa Golcunda setuju. Madanna dan Akhanna diseret ke jalanan dan dibunuh. Setelah jatuhnya Bijapur pada tahun 1686, Aurangzeb memulai serangan ke Golcunda pada awal tahun 1687 dan Golcunda direbut dan dianeksasi pada tahun 1687.